Le président du Congrès est élu chaque année, au cours de la première séance de la session administrative, parmi les membres du Congrès.

Il est élu au scrutin uninominal secret, à la majorité absolue aux deux premiers tours et à la majorité relative en cas de troisième tour.

Une condition particulière de quorum est fixée pour cette élection, trois cinquièmes au moins des membres du Congrès devant être présents. Faute de ce quorum, la réunion se tient trois jours plus tard.

A noter que les fonctions de président du Congrès sont incompatibles avec celles de président d'une assemblée de province.

Le président du Congrès ouvre et clôt les sessions. Il fixe l'ordre du jour des séances après avis du bureau et convoque les membres du Congrès. En cas de session extraordinaire, l'ordre du jour est fixé par l'autorité qui a demandé sa réunion.

En outre, il préside les séances du Congrès et exerce la police dans l'enceinte de celui-ci. Il peut faire expulser de l'hémicycle toute personne qui trouble l'ordre.

Par ailleurs, le président du Congrès dirige les services administratifs et nomme aux emplois. Il nomme également les collaborateurs politiques, nécessaires au fonctionnement des groupes d'élus. En outre, il est ordonnateur des dépenses d'investissement et de fonctionnement du Congrès, tant en ce qui concerne les services administratifs que les groupes d'élus.

Enfin, le président du Congrès intente les actions et défend devant les juridictions au nom du Congrès. A ce titre, il est seul compétent pour défendre les actes du Congrès et plus particulièrement les délibérations.