Depuis la délibération n° 125 du 19 mai 2016, le CCR est composé de dix-huit membres répartis en deux collèges :
- Le collège des membres institutionnels qui reste au nombre de six, conformément à la composition prévue par la délibération n° 082 du 25 juillet 2000.
- Le collège scientifique qui passe de cinq à douze membres afin de représenter tous les acteurs de la recherche en Nouvelle-Calédonie en 2016.
Le collège des membres institutionnels est le suivant :
- Le président du congrès de la Nouvelle-Calédonie ou son représentant, président du conseil ;
- Le haut-commissaire de la République en Nouvelle-Calédonie ou son représentant ;
- Un membre du gouvernement de la Nouvelle-Calédonie ou son représentant;
- Le président de chaque assemblée de province ou son représentant.
Le collège des membres scientifiques est le suivant :
- Le président de l’université de la Nouvelle-Calédonie ou son représentant ;
- Le représentant de l’institut de recherches et de développement (IRD) en Nouvelle-Calédonie ou son représentant ;
- Le délégué régional de l’IFREMER ou son représentant ;
- Le directeur général de l’institut agronomique néo-calédonien (IAC) ou son représentant ;
- Le directeur de l’institut Pasteur de Nouvelle-Calédonie ou son représentant.
- Le directeur de l’antenne du Bureau de recherches géologiques et minières (BRGM) en Nouvelle-Calédonie ou son représentant ;
- Le président du Centre national de la recherche scientifique (CNRS) ou son représentant ;
- Le représentant du centre de coopération internationale en recherche agronomique (CIRAD) ou son représentant ;
- Le directeur de l’Institut archéologique de la Nouvelle-Calédonie et du Pacifique (IANCP) ou son représentant ;
- Le directeur du Centre national de la recherche technologique (CNRT) Nickel et Environnement ou son représentant ;
- Le directeur général du Centre Hospitalier Territorial (CHT) Gaston Bourret ou son représentant ;
- Le directeur de l’Aquarium des lagons ou son représentant.